曙光拓撲結構圖

集群 GPU 計算節點共配置 200 余塊 NVIDIA Tesla C2050 GPU 卡，共提供 118.15Tflops 計算能力，助中山大學進入 2011 年中國高性能計算機性能 TOP100 排行榜。

曙光公司自主研發的Parastor并行文件系統，兩個IO節點，對計算節點提供80G的IO帶寬，可大大提升系統的IO性能。Parastor優勢還包括: 基于對象存儲，使存儲更具智能化;對單個目錄下的元數據操作進行優化;數據安全性，可選支持多副本方式，充分保護數據安全性;極佳的可擴展性?；趯ο蟠鎯Φ捏w系結構使系統可以支持幾萬個客戶節點，存儲容量支持Petabytes級別;由于Parastor已經部署到多個不同規模大小的實際機群系統中，可滿足商業和安全應用對正常運行時間的要求;支持多種主流的網絡連接，包括TCP/IP，Myrinet，Infiniband，Qrandrics等;和曙光集群管理軟件結合，對文件系統部署、文件系統管理、文件系統快速恢復提供良好支持。

三套網絡，專網專用。高速計算網采用Inifiband 40Gbps全互聯高速網絡，用于并行計算時的數據交換和計算通訊;數據網亦稱接入網，采用高性能千兆以太網，主要用于用戶接入、IO讀寫等，同時數據網又作為高速計算網的備份;管理網采用千兆以太網，用于系統管理控制、系統監控、作業的遞交、作業監控等監控管理方面的數據通訊，同時管理網又作為數據網的備份。

眾多并行基礎軟件。集群應用范圍很廣，因此需要很多基礎軟件。操作系統：業界知名的Suse 64位企業版Linux操作系統，性能卓越，安全可靠。MPICH和LAM-MPI：最穩定、適用性最好MPI實現，用于跨結點并行程序的開發。并行虛擬機PVM：用于異構系統下的并行程序開發。編譯環境：提供GNU C/C++編譯器、GNU Fortran77/90/95編譯器、PGI/Intel C/C++、Fortran編譯器、Java、Python、QT、PERL開發環境，滿足多種程序開發需求;特別提供用于GPU程序開發的驅動、cudatoolkit和gpucomputing SDK.

數學庫，程序優化的重要手段。曙光提供AMD核心數學庫ACML、基本線性代數庫BLAS、針對特定平臺性能調優的高性能BLAS庫GOTO和ATLAS、線性代數計算子程序包LAPACK、可擴展線性代數庫ScaLAPACK、并行可擴展科學計算工具箱PETSc、傅里葉變換數學庫FFTW。

高性能計算平臺管理軟件。曙光自主研發的Gridview支持GPU計算監控，用戶可隨時了解GPU軟硬件信息，如GPU的型號、軟件版本、主頻、風扇轉速和溫度變化等。

曙光Gridview軟件監控界面

曙光公司表示，該系統的構建主要遵從用戶的實際需求，秉承先進型、成熟性、可靠性、以及可擴展性的原則，不僅能夠滿足目前業務的需要，還能適應未來技術發展的趨勢，具備實用性與高性價比特點，可有效保護用戶的投資。此次中山大學計算科學科研團隊高性能計算系統的成功構建，再一次說明了曙光高性能解決方案綠色節能的獨特優勢。

目前，中山大學的高性能計算平臺上有多個領域的各種應用，例如生命科學領域的進化基因組學與基因功能分析整合及應用、地理科學領域的基于網格計算的地理模擬系統(GSS)平臺、環境科學領域的城市群空氣質量數值預報和應急救援污染擴散預警、生物化學領域的QM/MM-FEP研究亞鐵螯合酶催化機制、信息科學領域的云計算-桌面虛擬化等等。

作為國內高性能計算領域領軍企業，曙光公司推出“產品+軟件服務+解決方案”一攬子GPU產品解決方案，以重點客戶、重點區域為突破點，帶動整體GPU產品銷售;并以其特有的GPU監控、加速系統等國內領先技術在GPU行業技術領域取得了重大的突破成果。