浪潮生命科學一體機

基因成為21世紀寶貴戰略資源

21世紀是眾所公認的生命科學的世紀,基因已經成為一種寶貴的戰略資源和財富,是未來國際間競爭的焦點。而在基因研究領域,由生命科學和計算機科學相結合形成的生物信息學,已經成為揭示大量復雜生物數據潛藏奧秘的支撐性學科之一,其發展關乎基因研究的速度和成果。

數據處理難題制約基因研究

目前,基因測序技術呈現快速發展的勢頭,第二代測序技術可以一次完成數萬至數百萬條DNA分子的序列測定,使得科學家在極短時間內對人類基因組進行細致研究成為可能。不過,這也改變了原本基因研究中“測序沒有處理快”的局面,大量的測序數據得不到及時處理,嚴重影響了基因研究進程和成果涌現。造成這一瓶頸的原因,其中既有數據處理平臺計算力和計算效率不足的因素,更重要的在于基因測序軟件使用門檻較高。

浪潮高性能計算總經理劉軍表示,每種測序技術對應的生物信息學的分析方法存在或多或少的差異,而每種分析方法都有特定的流程,會涉及到7-8種分析軟件。一方面,軟件種類的復雜導致部署繁瑣、周期延長、管理困難;另一方面,較高的專業性也導致無計算機或生物信息學基礎的人員很難勝任數據分析工作。這些問題大大限制了數據分析的速度,制約著生物信息學科的發展以及應用。因此,開發一種易操作的生物信息學分析的軟硬一體化平臺,已經成為加快基因數據分析速度,更好推動我國基因戰略發展的當務之急。

浪潮生命科學一體機“一鍵式”提升基因研究效率

據介紹,浪潮生命科學一體機的生物信息平臺后臺由浪潮服務器支撐,集成了基本的生物信息學工具,如Bowtie、Bwa等二代測序的比對工具, Fastqc等數據預處理工具等,能夠進行全基因組重測序等二代測序的數據分析。完善的軟件組合使得用戶可以根據實際研發需求,自定義數據處理流程并實現一鍵式運行,在大幅降低部署、優化時間的同時,也通過“傻瓜式”操作降低了使用門檻。此外,瀏覽器登陸訪問功能,使得操作人員不再受工作地點的限制,實現移動辦公。

據介紹,浪潮生命科學一體機將持續收集基因數據,豐富測序比對和數據處理工具,為基因研究的用戶提供便利,并致力于成為我國基因研究的重要平臺型裝備,為我國在該領域取得領先優勢提供更好的支撐。

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sunyingying

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