如今，“精準醫療”已被納入國家“十三五”規劃，成為中國醫藥大健康產業的驅動引擎，帶動了中國基因測序、生物大數據研究等一系列產業的高速發展。

成立于2015年的重慶浦洛通生物信息技術有限公司（下文簡稱“浦洛通”）正是一家致力于“健康中國、精準醫療”的科技企業，專注于新一代基因組學技術在生命科學研究領域的信息分析及產業化應用，為更多的研究學者提供全面、個性化解決方案，用科技服務大眾。

為提升基因測序任務的速度，向客戶提供更高效的服務，并更快的實現科技成果轉化，浦洛通攜手聯想，建立起高性能計算平臺以及配備完善的實驗室科研轉化平臺，逐步形成了完備的生命科學IT及科研轉化兩大產業，為今后走向大數據時代奠定了寶貴的數據基礎。

構建新計算平臺加速科研成果轉化

浦洛通業務核心系統為基因測序平臺，但作為一家初創企業，浦洛通在前期設備的投入上相對謹慎。此前，浦洛通采用四路服務器用于基因測序計算，同時還要應對公司對外的業務工作需求和公司內的科研、培訓等任務。隨著業務量增長，四路服務器性能已經捉襟見肘。

例如，此前浦洛通對外服務的一個基因測序任務的時間約1個月，已經難以匹配業務需求。浦洛通希望將執行一個基因測序任務的時間控制在15天以內，目標是7天之內能夠出結果。

同時，浦洛通公司員工以基因、生物一類的專業人員為主，缺乏專業的IT運維人員；浦洛通辦公地主要依托西南大學，沒有獨立機房，設備供電、空間、散熱都存在較大限制。

為打破計算瓶頸，浦洛通急需建立具有良好的可擴展性的新計算平臺，以滿足業務對時間上的嚴苛要求；為降低部署和管理的復雜度，浦洛通需要包含計算、存儲、網絡等設備及服務的一整套解決方案；整套系統建設還需要考慮空間占用和能耗節省，以滿足綠色環保需求。

5倍性能提升，聯想高性能計算平臺為基因測序加速度

近日，2018年國際高性能計算機大會（ISC）上傳來好消息：聯想以117套的份額成為首家在該榜單中問鼎全球第一的中國廠商，躍升為全球最大超算平臺提供商。此前，聯想已連續四屆榮膺HPC TOP500榜單中國第一、全球第二，在HPC領域有著深厚的積淀。

多年來，聯想憑借卓越的技術實力，受到了眾多企業關注。在此次項目中，浦絡通經過深入調研、論證和測試，決定與聯想攜手，通過聯想高性能計算平臺來支撐基因測序任務，公司最終實現了近5倍的性能提升。

聯想高性能計算集群采用Lenovo?System x3650 M5服務器承載管理、登陸、存儲IO節點三個功能；配置了聯想集群管理軟件來簡化集群部署和管理；所有計算節點之間通過56 Gb IB計算網絡連接，所有節點之間通過Lenovo千兆管理網絡進行連接。

人工智能的大趨勢下,機器學習也好，IOT也好，都是為了提升效率的手段，更多在于找到高效獲取數據的場景。在這樣的大趨勢下，聯想已經意識察覺到了HPC客戶需求的新變化，所以除了提供基于AI的超算軟硬件方案，聯想還將致力于推動AI+HPC的應用落地，LiCO平臺將扮演越來越重要的角色，因為它給了用戶更多的選擇性。

得益于采用聯想LiCO智能管理軟件的高性能計算集群，浦洛通基因測序平臺實現了5倍的性能提升，將整個基因測序時間由一個月降低到小時級別，大大超出了浦洛通業務初期的基本需求。隨著業務量增加，浦洛通只需在當前架構下增加額外的計算資源即可實現平滑的性能升級，無需進行架構改動。

聯想高性能計算集群提供了自動化部署能力，操作系統、集群管理軟件、集群監控軟件、作業調度軟件、計費軟件、分布式文件系統軟件、編譯軟件、MPI庫軟件和IB網絡管理軟件都可實現快速部署和自動配置，安裝過程中無需手動干預，大大簡化了集群的部署過程。

同時，借助圖形界面的集群管理工具，浦洛通能夠在一個界面實現集群的集中管理，包括集群管理、任務調度、資源計費、作業提交、用戶管理等等，有效簡化了集群的管理難度，顯著降低了TCO。

此外，聯想高性能計算平臺已將整個架構做到了目前HPC系統簡化的極致，在簡化管理的同時也將偶發故障的可能性降到了最低，為浦洛通基因測序平臺提供了穩定可靠的支撐。

浦洛通作為一家基因檢測和診斷的生物高科技公司，立足于技術服務與產品創新，集中力量推動新技術進展，致力于繼續保持公司在西南地區的基因檢測技術領先地位，并向國內領先，國際先進方向而努力，始終立于同行業技術前沿和領先水平。

攜手聯想，以聯想高性能計算平臺為支撐，浦洛通向著“健康中國、精準醫療”的產業升級方向邁進了一大步，成為以技術驅動“精準醫療”的一名踐行者。